MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	TAAAA	2	10	213	222	80 %	20 %	0 %	0 %	386829696
2	NC_017762	TTA	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829696
3	NC_017762	ACT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829696
4	NC_017762	TCA	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829696
5	NC_017762	TCT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829696
6	NC_017762	TGTT	2	8	360	367	0 %	75 %	25 %	0 %	386829696
7	NC_017762	GTTTT	2	10	368	377	0 %	80 %	20 %	0 %	386829696
8	NC_017762	TTG	3	9	387	395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829696
9	NC_017762	TTTG	2	8	411	418	0 %	75 %	25 %	0 %	386829696
10	NC_017762	AG	4	8	452	459	50 %	0 %	50 %	0 %	386829696
11	NC_017762	AAGAGT	2	12	468	479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829696
12	NC_017762	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829696
13	NC_017762	TTC	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829696
14	NC_017762	AGA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829696
15	NC_017762	TAT	2	6	707	712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829696
16	NC_017762	CT	3	6	715	720	0 %	50 %	0 %	50 %	386829696
17	NC_017762	TAAG	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	386829696
18	NC_017762	TATGGA	2	12	812	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829696
19	NC_017762	ATT	2	6	897	902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829696
20	NC_017762	CTTG	2	8	986	993	0 %	50 %	25 %	25 %	386829696
21	NC_017762	TTCT	2	8	1018	1025	0 %	75 %	0 %	25 %	386829696
22	NC_017762	TCA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829696
23	NC_017762	TTG	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829696
24	NC_017762	AGGA	2	8	1066	1073	50 %	0 %	50 %	0 %	386829696
25	NC_017762	GAT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829696
26	NC_017762	TTATAA	2	12	1090	1101	50 %	50 %	0 %	0 %	386829696
27	NC_017762	TAT	2	6	1112	1117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829696
28	NC_017762	ACA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829696
29	NC_017762	ATC	3	9	1134	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829696
30	NC_017762	AT	3	6	1146	1151	50 %	50 %	0 %	0 %	386829696
31	NC_017762	ACT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829696
32	NC_017762	TAAA	2	8	1179	1186	75 %	25 %	0 %	0 %	386829696
33	NC_017762	TCC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829697
34	NC_017762	ATA	2	6	1357	1362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829697
35	NC_017762	TA	3	6	1361	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	386829697
36	NC_017762	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829697
37	NC_017762	ATT	2	6	1449	1454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829697
38	NC_017762	GCT	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386829697
39	NC_017762	TAAAA	2	10	1510	1519	80 %	20 %	0 %	0 %	386829697
40	NC_017762	CCA	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386829697
41	NC_017762	CTC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829697
42	NC_017762	ACA	2	6	1713	1718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829697
43	NC_017762	TTG	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829697
44	NC_017762	T	6	6	1789	1794	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
45	NC_017762	T	6	6	1880	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
46	NC_017762	TGA	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829698
47	NC_017762	TTCT	2	8	1977	1984	0 %	75 %	0 %	25 %	386829698
48	NC_017762	T	6	6	2082	2087	0 %	100 %	0 %	0 %	386829698
49	NC_017762	TTA	2	6	2096	2101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829698
50	NC_017762	TTGGA	2	10	2184	2193	20 %	40 %	40 %	0 %	386829699
51	NC_017762	T	7	7	2223	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
52	NC_017762	ATA	2	6	2447	2452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829699
53	NC_017762	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
54	NC_017762	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	386829699
55	NC_017762	AAT	2	6	2630	2635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829699
56	NC_017762	AAT	2	6	2637	2642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829699
57	NC_017762	TTC	2	6	2656	2661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829699
58	NC_017762	TCA	3	9	2694	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829699
59	NC_017762	AAAAT	2	10	2709	2718	80 %	20 %	0 %	0 %	386829699
60	NC_017762	TAT	2	6	2734	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829699
61	NC_017762	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829699
62	NC_017762	ATT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829699
63	NC_017762	CTT	2	6	2914	2919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829699
64	NC_017762	TCA	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829700
65	NC_017762	AAT	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829700
66	NC_017762	TTGTCT	2	12	3133	3144	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829700
67	NC_017762	ATC	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829700
68	NC_017762	AAG	2	6	3242	3247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829700
69	NC_017762	AAT	2	6	3293	3298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829700
70	NC_017762	T	6	6	3413	3418	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
71	NC_017762	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829701
72	NC_017762	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829701
73	NC_017762	A	6	6	3608	3613	100 %	0 %	0 %	0 %	386829701
74	NC_017762	T	6	6	3668	3673	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
75	NC_017762	T	7	7	3687	3693	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
76	NC_017762	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
77	NC_017762	ATAA	2	8	3777	3784	75 %	25 %	0 %	0 %	386829701
78	NC_017762	TAA	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829701
79	NC_017762	T	7	7	3799	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
80	NC_017762	GATA	2	8	3849	3856	50 %	25 %	25 %	0 %	386829702
81	NC_017762	GTTT	2	8	3907	3914	0 %	75 %	25 %	0 %	386829702
82	NC_017762	GTA	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829702
83	NC_017762	CTA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829702
84	NC_017762	TGAT	2	8	3983	3990	25 %	50 %	25 %	0 %	386829702
85	NC_017762	ATT	2	6	4036	4041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829702
86	NC_017762	TCA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829702
87	NC_017762	TACC	2	8	4115	4122	25 %	25 %	0 %	50 %	386829702
88	NC_017762	TA	3	6	4123	4128	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
89	NC_017762	CATA	2	8	4167	4174	50 %	25 %	0 %	25 %	386829702
90	NC_017762	TCC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829702
91	NC_017762	TAAT	2	8	4304	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
92	NC_017762	AT	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
93	NC_017762	CCAA	2	8	4334	4341	50 %	0 %	0 %	50 %	386829702
94	NC_017762	ATC	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829702
95	NC_017762	TAT	2	6	4393	4398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829702
96	NC_017762	CTG	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386829702
97	NC_017762	T	6	6	4412	4417	0 %	100 %	0 %	0 %	386829702
98	NC_017762	CTA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829702
99	NC_017762	CTT	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829702
100	NC_017762	TCA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829702
101	NC_017762	GTTATT	2	12	4595	4606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829702
102	NC_017762	TCC	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829703
103	NC_017762	CATT	2	8	4642	4649	25 %	50 %	0 %	25 %	386829703
104	NC_017762	AGA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829703
105	NC_017762	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829703
106	NC_017762	CTC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829703
107	NC_017762	TTATC	2	10	4804	4813	20 %	60 %	0 %	20 %	386829703
108	NC_017762	AT	3	6	4829	4834	50 %	50 %	0 %	0 %	386829703
109	NC_017762	TTC	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829703
110	NC_017762	ATC	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829703
111	NC_017762	CTA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829703
112	NC_017762	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	386829703
113	NC_017762	TCA	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829703
114	NC_017762	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829703
115	NC_017762	TTGTCT	2	12	4980	4991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829703
116	NC_017762	ATC	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829703
117	NC_017762	AAG	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829703
118	NC_017762	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829703
119	NC_017762	T	6	6	5260	5265	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
120	NC_017762	TTGT	2	8	5393	5400	0 %	75 %	25 %	0 %	386829704
121	NC_017762	A	6	6	5449	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	386829704
122	NC_017762	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829704
123	NC_017762	T	6	6	5487	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
124	NC_017762	ATA	2	6	5503	5508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829704
125	NC_017762	AAT	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829704
126	NC_017762	ACT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829704
127	NC_017762	AAAAAC	2	12	5669	5680	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386829704
128	NC_017762	T	6	6	5689	5694	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
129	NC_017762	AAT	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829705
130	NC_017762	CTT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829705
131	NC_017762	AAT	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829705
132	NC_017762	ACTT	2	8	5843	5850	25 %	50 %	0 %	25 %	386829705
133	NC_017762	TAT	2	6	5905	5910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829705
134	NC_017762	T	6	6	5913	5918	0 %	100 %	0 %	0 %	386829705
135	NC_017762	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829706
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137	NC_017762	ATA	2	6	6115	6120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829706
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